АО «Завод ПРОТОН» организован в 2004 году на базе Экспериментального завода «Протон» Московского института электронной техники, который начиная с 1978 - 1982 годов прочно утвердился, как один из лучших производственных коллективов Министерства образования СССР.

В настоящее время АО «Завод ПРОТОН» представляет современное, высокотехнологичное производство, оснащённое высоко автоматизированным технологическим оборудованием и поточными линиями.

Основным направлением деятельности «Завода ПРОТОН», как и в прошлые годы, остаётся изготовление вычислительной техники, электронных узлов и блоков как для гражданского назначения, так и в интересах Министерства обороны РФ.

Размещение МИЭТ(ТУ) и завода «ПРОТОН» в г. Зеленограде – центре Российской микроэлектроники, создает дополнительные возможности для создания самой совершенной микроэлектронной аппаратуры, средств вычислительной техники и систем управления, что уже давно привлекло внимание разработчиков В и ВТ к творческим коллективам научно-исследовательской части (НИЧ) МИЭТ(ТУ).